>Kokiu formatu jis nepalaiko ir kokie formatai 'butu paduodami' dazniausiai?

Dolby TrueHD
http://www.dolby.com/us/en/consumer/technology/home-theater/dolby-truehd.html
DTS HD MASTER
http://www.dts.com/professionals/sound-technologies/codecs/dts-hd-master-audio.aspx

Dar yra LPCM, bet tada reikia tokio grotuvo, kuris mokėtų iškoduoti Dolby 
TrueHD/DTS  HD Master į LPCM garso takelį ir du HDI išėjijmus - vieną 
vaizdui, kitą garsui į tavo procesorių

Šie formatai yra losless tipo. Žiūrėk tą pačią nuorodą:
http://www.blu-raystats.com/Stats/Stats.php

> atrinkau Himedia HD900B ir IconBitXDS1003D.

Apie jų sugebėjimus ir pan. geriausia tau užklausti HDTVlietuva forume. Man 
rodos šie turi palaikyti ir 3D mkv.

>Tai dabar klausimas kuriu variantu yra daugiau 'pasiuloje' t.y. LM & co, ar 
>ISO 3D ar MKV 3D? Turbut pagal tai ir reiktu rinktis.

Nesidomėjau, nepasakysiu.